130521 Springer Exemplar調査中
Springer Exemplar の調査はじめました。
ー以下調査めもー
springerexemplar
About
・Exemplar searches over 1,900 journals and close to 4,000 books from Springer’s collection
・ all major subject areas including the life sciences, medicine, engineering, mathematics, computer science, business, and law,
・Exemplar was created via a collaboration between Springer Science & Business Media and the Center for Biomedical and Health Linguistics.
・For more information, to send feedback or propose future ideas, →exemplar@springer.com
・Authors 、Teachers、Editors and reviewers
About Springer
・the second-largest publisher of journals in the science, technology, and medicine (STM) sector
・ the largest publisher of STM books.
・Springer is part of Springer Science+Business Media,one of the world’s leading suppliers of scientific and specialist literature.
・publishes over 1,700 journals and more than 5,500 new books a year,
・ has the largest STM eBook Collection worldwide.
ファセット項目
・Subject
・country
・Publication
・publication type
・publisher
・open access articles only（☆無料のみ）/all articles
・該当する数が見られる（see all...）
・それぞれの項目中の該当する項目の数をと数字とグラフで表示
year published
・年グラフでそのtermやphraseの出現度合いを確認することができる
・その年をクリックすると、その年の論文のみが検索できる（ファセット式）
matching articles
・青時の単語にマウスをフォーカスすると、jornalの表紙と詳細（ジャーナル名、論文の題名、著者名）が表示される
・検索語句の前後の単語がわかる
splinger.com
splinger linik
【筋書き】
→導入
・Splinger exemplarは電子ジャーナル出版社シュプリンガー(Splinger)社が運営する、無料の英語論文の著者向けサーピスです。
ある単語が、学術文献の中でどのように使用されているのかシュプリンガーの1900誌のジャーナルの中から見つけ出すことができます
分野はライフサイエンス、医学、工学、数学コンピューターサイエンスだけでなく、ビジネス、法学も検索対象です。また対象論文は全て査読済みです。
→検索
・p53,iPS,Muscular dystrophy・・
→見方
→左項目、ファセットの説明
→途中・・
130517 バイオの買物.comを使って生命科学製品を比較する
バイオの買い物.comを使って生命科学製品の比較をする
バイオの買物.comは、ライフサイエンス分野でよく使われる試薬などの製品情報を各メーカーから収集し、研究者が最も適した製品を簡単に確実に発見できることを目的としたサイトです。「製品を検索する」だけではなく「新しい製品を発見できる」カタログを目指して作られています。
デザインが特に大きく変わったところは、”まとめて抗体検索”です。
まとめて抗体検索では複数の分類項目を組み合わせた検索（ファセット検索）も非常にわかりやすく選択できるうようになっています。
※今回の動画は、以前バイオの買い物.comを作成した先輩の動画作成技術を学び、なんとcamtasiaの動画作成の裏ワザを駆使して作成しました・ω・
"バイオの買い物.com" ぜひご活用ください☆
動画のご意見ご要望お待ちしています。
ーーーーー以下、特徴メモです。ーーーーー
[まとめてカタログ]
・左側のファセット機能で、メーカーとカテゴリーを絞り込める
＊特徴
・まとめてカタログはメーカーウェブサイトの製品解説を要約→ウェブサイトのレスポンスが早い
・製品がしっかりアノテーション（カテゴリー分け）されていること
[まとめて抗体検索]（抗体の由来（宿主）や用途を限定した検索を行いたい場合）
・製品名をクリック→メーカーHPの製品情報へ
・スポンサー以外の抗体を表示するには（登録ユーザー）ログインが必要
＊特徴
・蛍光色素については、蛍光波長ごとに並べ替えし、色で分かるようにしている
・検索条件にマッチする製品数、宿主、蛍光色素などの情報は、スポンサーであるかないかに関わらず、全登録製品からリストアップ
・高速な抗体検索システム
・在庫のある製品を優先して表示
・類義語検索システムでは Uniprot が提供しているデータベースから類義語辞書を構築し、検索方法を細かくチューニングしている
・スポンサーの製品を優先して表示するようにしているが、研究者の利便性を損なわないために、スポンサーにまだなっていないメーカーであっても製品を登録している。
（検索条件に合うものがスポンサー製品にない場合は、自動的に非スポンサーの製品が表示される。）
（検索条件にマッチする製品数、宿主、蛍光色素などの情報は、スポンサーであるかないかに関わらず、全登録製品からリストアップしている。）
・ まとめてカタログの抗体カテゴリー でも抗体検索ができるが、抗体に特化した仕組みではないため、例えば反応性（交差性）による絞り込みは行えず、類義語検索も提供していない。分類はバイオの買物.comが手作業で行っている。
それに対して まとめて抗体検索 は抗体に特化した仕組みにより、通常はこちらの方が抗体を見つけやすくなっっている。
☆しかし、二次抗体の検索は まとめてカタログの二次抗体カテゴリー をお勧め！
130412 とーごーtv整理終了。
togoTVの整理終わりました(*>ω<*)ゞ
見て呉れにおいて、
番組名と番組の説明文のみのカラムになったため、ヨウツベ動画が大きく表示されています！(。･o･｡)ﾉ
ごらんくださいヽ(*´□｀*)ﾉ
→TOGO TV：http://togotv.dbcls.jp/ja/
＊残りのtogotvの整理分が少しあったのですが、Onoさんが作業してくださり、早く仕上がりました。間に合わずすみません。
ありがとうございます(*＞_＜*)
また実際に体裁に直していただき、ありがとうございます。
整理がおわったので、休戦していましたバイオの買物の撮影に入ってます(ゝ∀・｀
130308 バイオの買物
調査と筋書作成中です。
＜筋書き案＞
１．カテゴリーをたどる
→サイトの見方の説明（メーカーで絞り込むこともできる。但し複数のメーカーを組み合わすことはできない。）
→まとめてカタログ
→DNA RNA分子生物学
→PCR
→PCR酵素
→PCR酵素名で分類
→AmpliTaq Gold
2.製品を検索する
→”gold”を入力
→ AmpliTaq Gold® DNA Polymerase, 1, 000 units with Buffer I
(or AmpliTaq Gold® Fast PCR Master Mix (25 rxns))
3.製品の概要を見る
→類似の製品を探す
→メーカーのサイトに移動
→簡易マニュアル;Quick Reference Card、データシート:Application Note、プロトコールのリンク
☆☆☆値段比較の例☆☆☆
（→DNA RNA分子生物学
→クローニング・遺伝子組換え）
→”制限”or"enzyme"と入力
→制限酵素名で分類
→ArtⅡ
→値段比較ができる、切れる配列も記載。
☆☆☆
4.困ったときは
→まとめてカタログの使い方（上の”？”をクリック）
→twitter,FB
5.まとめて抗体検索
（（選択式でできる抗体検索））
→まとめて抗体検索
→Klf4 or sox2
→特異性：human、用途:Western Blotting（メーカー、在庫、標識etc...でファセット検索可能）
→製品名をクリック
→メーカの製品情報へ
→戻る
→スポンサー以外の抗体を表示（ログインすれば見られる）
※→”２次抗体検索はこちら”をクリック（紹介程度）
→"まとめて抗体検索FAQ"をクリック
6.情報
→・セミナー・キャンペーン・ニュース
→その他
130305 抗体検索サイトBioBreaを使い倒す
”抗体検索サイトBioBreaを使い倒す”の動画を作成終了しました。
動画→ http://togotv.dbcls.jp/20130301.html
BioBreaはPubMedともリンクしており、抗体を検索するとその抗体が使用された最新の論文も表示され、またある論文で使用された抗体の製品情報とリンクした一覧も表示されます。（最新の論文5報しか表示されないのがネックだったりします）
さらに複数の分類項目を組み合わせた検索（ファセット検索）や製品比較もでき、抗体を調べるには便利なサイトの一つです。
では、BioBrea使い倒して見てください(*^_^*)
130219 BioBrea
抗体検索サイトBioBrea調査終了、動画撮影中です。
[筋書き]
biobrea
→casp(カスパーゼ)
→右側にpublication数、商品情報、
→ファセット検索
・gene;CASP9
・application:western blot
→caspase-9 p35 Antibody (H-170)
→製品詳細の見方
・publicationで論文へ移動→論文で使用されている他の製品が載っている→pubmedに移動
→戻る→比較４つ
→citeabを少し紹介！
[調査]
citeabについて
＊メリット
・browse機能
・引用論文が５つ以上掲載されている。
＊デメリット
・ファセット機能の選択の種類が少ない。
・製品詳細があまり書かれていない。
・application（抗体の適用実験方法）がnone availableになってしまっているものも多くある。
＊他
・引用論文その他の事情で検索結果の上位が異なる。
・またカンパニーによっても収録数に差がある。
[メモ]
・biobrea
Using BioBrea, scientists should be able to find all antibodies related to genes/proteins, targets or disease or an area of interest and narrow down the results using many different filters. BioBrea provides detailed product information and literature citations which will help scientists identify high quality antibodies that are frequently used by other scientists.
・抗体
（適応する実験方法）application
(免疫動物) host
・抗体用語集
130212 BioBrea調査
抗体検索サイト、BioBrea調査中です。
・BioBrea調査
カーソルをのせると商品の情報がわりと詳細に表示。
また検索結果にPublications数も表示される。（検索結果はPublicationsの多い順）
検索結果画面：company ロゴ,recommend
☆抗体の詳細画面（Product Details）では、Publicationsのtop5（新しい日付順）の論文のリンクが貼られている。（５つ以上は表示されない。）
Product Details: Company,ID,Description,Applications,Host,Reactivity,Type,Form,
Clone,Quantity,Price,Publication,Genes,Publication(top 5 of ...),companyをクリックすると商品購入ページにいく。
☆四角にcheckを入れると、比較できる。(compareボタンをクリック。注意；４つまで比較可能。)
☆さらに、ファセット検索も可能。（gene,type,application,host,reactivity,company）
・CiteAb調査中・・
Browse Applications(application,compony,host,reactiity)
Browse Antibodys
Add a Publication
・筋書きメモ
anti-CD3,811 products found for 'anti-CD3' (matched on product name, gene name and gene synonyms)
→search
→検索結果画面
・・・・・
最後にCiteAbを少し紹介？
