nimnim's blog ＠統合牧場

おもにライフサイエンスデータベース統合TVのめも日記です。BioやScienceに興味がある小学生〜大人の方までどうぞご覧ください。 普段は細菌とたわむれています。(・▽・)。【分子細菌学/togotv/サイエンスデータベース】統合牧場から放牧中です。

130308 バイオの買物

調査と筋書作成中です。

＜筋書き案＞

１．カテゴリーをたどる

→サイトの見方の説明（メーカーで絞り込むこともできる。但し複数のメーカーを組み合わすことはできない。）

→まとめてカタログ

→DNA　RNA分子生物学

→PCR

→PCR酵素

→PCR酵素名で分類

→AmpliTaq Gold

 

2.製品を検索する

→”gold”を入力

→ AmpliTaq Gold® DNA Polymerase, 1, 000 units with Buffer I

(or AmpliTaq Gold® Fast PCR Master Mix (25 rxns))

 

 

3.製品の概要を見る

→類似の製品を探す

→メーカーのサイトに移動

→簡易マニュアル;Quick Reference Card、データシート:Application Note、プロトコールのリンク

 

☆☆☆値段比較の例☆☆☆

（→DNA　RNA分子生物学

→クローニング・遺伝子組換え）

→”制限”or"enzyme"と入力

→制限酵素名で分類　　

→ArtⅡ

→値段比較ができる、切れる配列も記載。

☆☆☆

 

4.困ったときは

→まとめてカタログの使い方（上の”？”をクリック）

→twitter,FB

 

5.まとめて抗体検索

（（選択式でできる抗体検索））

→まとめて抗体検索

→Klf4　or sox2

→特異性：human、用途:Western Blotting（メーカー、在庫、標識etc...でファセット検索可能）

→製品名をクリック

→メーカの製品情報へ

→戻る

→スポンサー以外の抗体を表示（ログインすれば見られる）

※→”２次抗体検索はこちら”をクリック（紹介程度）

→"まとめて抗体検索FAQ"をクリック

 

6.情報

→・セミナー・キャンペーン・ニュース

→その他

130305 抗体検索サイトBioBreaを使い倒す

”抗体検索サイトBioBreaを使い倒す”の動画を作成終了しました。

動画→　http://togotv.dbcls.jp/20130301.html　

 

BioBreaはPubMedともリンクしており、抗体を検索するとその抗体が使用された最新の論文も表示され、またある論文で使用された抗体の製品情報とリンクした一覧も表示されます。（最新の論文5報しか表示されないのがネックだったりします）

さらに複数の分類項目を組み合わせた検索（ファセット検索）や製品比較もでき、抗体を調べるには便利なサイトの一つです。 

 

では、BioBrea使い倒して見てください(*^_^*)

 

 

 

130219 BioBrea

抗体検索サイトBioBrea調査終了、動画撮影中です。

 

[筋書き]

biobrea 

→casp(カスパーゼ)

→右側にpublication数、商品情報、

→ファセット検索

・gene;CASP9

・application:western blot

→caspase-9 p35 Antibody (H-170)

→製品詳細の見方

・publicationで論文へ移動→論文で使用されている他の製品が載っている→pubmedに移動

→戻る→比較４つ

→citeabを少し紹介！

 

[調査]

citeabについて

＊メリット

・browse機能

・引用論文が５つ以上掲載されている。

＊デメリット

・ファセット機能の選択の種類が少ない。

・製品詳細があまり書かれていない。

・application（抗体の適用実験方法）がnone availableになってしまっているものも多くある。

＊他

・引用論文その他の事情で検索結果の上位が異なる。

・またカンパニーによっても収録数に差がある。

 

[メモ]

・biobrea

Using BioBrea, scientists should be able to find all antibodies related to genes/proteins, targets or disease or an area of interest and narrow down the results using many different filters. BioBrea provides detailed product information and literature citations which will help scientists identify high quality antibodies that are frequently used by other scientists.

・抗体

（適応する実験方法）application

(免疫動物) host

 

・抗体用語集

http://www.funakoshi.co.jp/products_faq/antibody_faq

130212 BioBrea調査

抗体検索サイト、BioBrea調査中です。

・BioBrea調査

カーソルをのせると商品の情報がわりと詳細に表示。

また検索結果にPublications数も表示される。（検索結果はPublicationsの多い順）

検索結果画面：company ロゴ,recommend

☆抗体の詳細画面（Product Details）では、Publicationsのtop5（新しい日付順）の論文のリンクが貼られている。（５つ以上は表示されない。）

Product Details: Company,ID,Description,Applications,Host,Reactivity,Type,Form,

Clone,Quantity,Price,Publication,Genes,Publication(top 5 of ...),companyをクリックすると商品購入ページにいく。

☆四角にcheckを入れると、比較できる。(compareボタンをクリック。注意；４つまで比較可能。)

☆さらに、ファセット検索も可能。（gene,type,application,host,reactivity,company）

・CiteAb調査中・・

Browse Applications(application,compony,host,reactiity)

Browse Antibodys
Add a Publication

 




・筋書きメモ

anti-CD3,811 products found for 'anti-CD3' (matched on product name, gene name and gene synonyms)

→search

→検索結果画面

・・・・・
最後にCiteAbを少し紹介？

130208 [文献検索][ポータル] CiNiiを使って日本語論文を検索する

こんにちは。

 

「CiNiiを使って日本語論文のを検索する」 （CiNiiの検索方法紹介動画）アップしました！＠牧場

 動画→ http://togotv.dbcls.jp/20130208.html

 

CiNiiとは、国立情報学研究所が提供する検索サイトで、日本語の論文や図書・雑誌などの学術情報を検索できるデータベース・サービスです。

 

 

 日本語の論文だけを探したいとき、学会や大学機関が出版している論文を探してみたいとき、はたまた図書館に読みたい論文がなかったり、行くのが面倒であったり・・

そんなときに使用すると便利です。

 

しかもなんと無料で読めてしまう論文が豊富にあるのです。。

 

 

高校生や中学生の方で論文読んでみたいといったときにも、検索システムが日本語なので利用しやすいので使ってみてください(^^♪

 

論文探したいけど、探し方わからない。そんなときはこのCiNiiを利用してみてはいかがでしょうか(*^_^*)

 

 

 

[定額制機関などの ご利用区分一覧]

機関定額制に参加してる大学や高専、機関（機関定額制参加機関一覧はここから見られます）からのアクセスにより、定額アクセスの論文本文を無料で閲覧しダウンロードできます。

また個人ID取得により、自宅や外出先のPCからでも定額制機関内と同じサービスを受けることができます。

(※定額制機関に所属している人は無料で、サイトライセンス個人IDを取得できます。)

 

 

 

 

 

 

 

 

130122　CiNii調査

明けましておめでとうございます。

現在”CiNii を使い倒す”の動画作成をしてます！

「CiNiiを使い倒す」の筋書きが概ね完成したので、動画撮影・編集作業に入りたいと思います。

何かCiNiiの使い方に関してご要望がございましたら、コメントください。

CiNii：　　http://ci.nii.ac.jp/

＜筋書き＞
（CiNii紹介：日本の学術論文を中心とした論文情報の提供サービス。学協会で掲載された論文、国内大学などの刊行物から検索可能...etc.）
（検索は簡易検索と詳細検索があると紹介）
→日本の論文をさがす
→ノロウイルス
→検索
→被引用件数が多い順
（出版年の新しい順、古い順で、ノロウイルスが（日本語の）論文に初めて掲載された年や最新のノロウイルス情報を知ることができる。＊すべて）
→「ノロウイルスによる食中毒について」をクリック。
＊引用論文5件を紹介。（見せる程度）
→J-STAGE
（アイコン：CiNii? PDF,CiNii? Link,webcat Plus,IR Free,J-STAGE,Jounal@rchive,医中誌、cross ref）
→本文PDF

＊詳細表示画面「ノロウイルスによる食中毒について」まで戻る。
→愛木 智香子
（著者の詳細な情報もわかる。）

＊詳細表示画面「ノロウイルスによる食中毒について」まで戻る。
→CiNiiに本文あり,被引用件数多い順
→論文検索
→「カキのノロウイルス汚染」のCiNii PDF-オープンアクセスをクリック！
（CiNii? PDF-オープンアクセス＝CiNiiに登録なしでも無料でダウンロード可能。定額アクセス可能＝定額機関での利用は無料、定額機関に所属しサイトライセンス個人IDでログインは無料、定額機関に所属なしで個人IDでログインは有料、定額機関に所属なしでID未取得Pray Per View利用は割高。）
→PDFが表示される。

＊CiNiiをクリックし、検索画面へ。
→CiNii本文収録刊行物ディレクトリ
(ディレクトリ検索で分野別や無料の刊行物などから論文を探し出せる。)
→分野からor提供条件（特にオープンアクセス）からor刊行物名から
→農学
→きのこ学会
→「日本きのこ学会誌」
→12101231
→本文：CiNiiをクリック！

＊知っ得（割愛）
RSS、Atomフィードの利用で検索結果をこまめにチェックできる。

＊電子ジャーナル等メモ

・J-STAGE

文部科学省所管の独立行政法人科学技術振興機構（JST）が運営する電子ジャーナルの無料公開システム。

電子ジャーナルの公開ノウハウを持たない学協会に対し、インターネット上で学術雑誌を公開するシステムとノウハウを、無料で提供している。日本の学術研究成果の広い範囲での流通の促進と、プレセンスの増加を目的としている。

・Journal@rchive

消滅

・CrossRef

電子ジャーナルへのリンクを一元的に管理するサービス。学術出版社が共同出資する非営利団体が運営する。

・応用物理学会

応用物理学に関する学会。

・日経BP

・NDL-OPAC

国立国会図書館が提供するNDL-OPACの雑誌記事索引。