130122 CiNii調査
明けましておめでとうございます。
現在”CiNii を使い倒す”の動画作成をしてます!
「CiNiiを使い倒す」の筋書きが概ね完成したので、動画撮影・編集作業に入りたいと思います。
何かCiNiiの使い方に関してご要望がございましたら、コメントください。
CiNii: http://ci.nii.ac.jp/
<筋書き>
(CiNii紹介:日本の学術論文を中心とした論文情報の提供サービス。学協会で掲載された論文、国内大学などの刊行物から検索可能...etc.)
(検索は簡易検索と詳細検索があると紹介)
→日本の論文をさがす
→ノロウイルス
→検索
→被引用件数が多い順
(出版年の新しい順、古い順で、ノロウイルスが(日本語の)論文に初めて掲載された年や最新のノロウイルス情報を知ることができる。*すべて)
→「ノロウイルスによる食中毒について」をクリック。
*引用論文5件を紹介。(見せる程度)
→J-STAGE
(アイコン:CiNii? PDF,CiNii? Link,webcat Plus,IR Free,J-STAGE,Jounal@rchive,医中誌、cross ref)
→本文PDF
*詳細表示画面「ノロウイルスによる食中毒について」まで戻る。
→愛木 智香子
(著者の詳細な情報もわかる。)
*詳細表示画面「ノロウイルスによる食中毒について」まで戻る。
→CiNiiに本文あり,被引用件数多い順
→論文検索
→「カキのノロウイルス汚染」のCiNii PDF-オープンアクセスをクリック!
(CiNii? PDF-オープンアクセス=CiNiiに登録なしでも無料でダウンロード可能。定額アクセス可能=定額機関での利用は無料、定額機関に所属しサイトライセンス個人IDでログインは無料、定額機関に所属なしで個人IDでログインは有料、定額機関に所属なしでID未取得Pray Per View利用は割高。)
→PDFが表示される。
*CiNiiをクリックし、検索画面へ。
→CiNii本文収録刊行物ディレクトリ
(ディレクトリ検索で分野別や無料の刊行物などから論文を探し出せる。)
→分野からor提供条件(特にオープンアクセス)からor刊行物名から
→農学
→きのこ学会
→「日本きのこ学会誌」
→12101231
→本文:CiNiiをクリック!
*知っ得(割愛)
RSS、Atomフィードの利用で検索結果をこまめにチェックできる。
*電子ジャーナル等メモ
・J-STAGE
文部科学省所管の独立行政法人科学技術振興機構(JST)が運営する電子ジャーナルの無料公開システム。
電子ジャーナルの公開ノウハウを持たない学協会に対し、インターネット上で学術雑誌を公開するシステムとノウハウを、無料で提供している。日本の学術研究成果の広い範囲での流通の促進と、プレセンスの増加を目的としている。
・Journal@rchive
消滅
・CrossRef
電子ジャーナルへのリンクを一元的に管理するサービス。学術出版社が共同出資する非営利団体が運営する。
・応用物理学会
応用物理学に関する学会。
・日経BP
121221 Reactome 調査終了
Reactom
http://www.reactome.org/ReactomeGWT/entrypoint.html
<調査結果>
データベースのホームページのデザインは多少変わっていましたが、インターフェイス自体は大幅に変更されていなかったので、改めて動画を作成するのは見合わせました。
以前作成された動画の手順通りで
Reactomeを使い倒す~1・基本編~ 2011
http://togotv.dbcls.jp/20110227.html#p01
Reactomeを使い倒す~2・Reactomeへのマッピング~ 2011
http://togotv.dbcls.jp/20110401.html#p01
パスウェイの閲覧や実験データ解析は可能です。
Reactomeは無料のパスウェイ解析ができるのでぜひ活用してみてください☆・ω・☆
121129 Integbioデータベースカタログ
Integbioデータベースカタログの動画作成が終了しました。
※今回の動画作成は紹介動画Sagace、生命科学系データベースカタログ、WINGproの筋書きを参考にして作成しました。
☆彡Integbioデータベースカタログのオススメは・・・
Integbioデータベースカタログはファセット(データベースの特徴ごとの分類項目)で目的のサイエンスデータベースを探索できること。
キーワード検索で、生物種や機関名を入力しデータベースを探し出すことができること。
などです。・∇・
☆☆
Integbioデータベースカタログの使い方
【紹介動画】
・本家
http://togotv.dbcls.jp/20121127.html
Integbioデータベースカタログは、 文部科学省、厚生労働省、農林水産省、経済産業省の4省による、生命科学系データベースの統合の一環として運営されているライフサイエンス分野の多種多様なデータベースの内容を収録した「カタログ型のデータベース」です。データベースが数多く存在する昨今、データベースをうまく使いこなすことが研究の進展を左右するといっても過言ではありません。しかし実際の利用者からは「必要なデータベースが見つからない」「何のデータベースがあるのか分からない」という声をよく聞きます。
Integbioデータベースカタログでは、国内外のデータベースを目的や対象、種類、生物種、提供機関別に分類し、それらの説明が日本語で書かれているのが特徴です。また個々のデータベースについてのレコードが公開されています。
【サイト】
・Integbioデータベースカタログ
121107 integbio
ひと通りintegbioカタログ動画の作成は終わりました。
本日はOさんがいらっしゃらなかったので、次回相談したいことのメモりました。
以下動画に入れるかどうかについて。
・生物種ごとの振分け表示。(生物種を入力すればリスト化できるが、存在する生物種を表示して欲しい)
・リスト化されたデータをソート(新しい・古い、名前、アクセス、更新頻度順など)。
・プロジェクト、組織ごとの分類表示。
・カテゴリを選択する度に一番上に戻らないようにして欲しい。
121101 integbioデータベースカタログ
integbioデータベースの動画作成中です。
*integbioデータベースについて
以下、あったら便利だなっと思いました機能を書留めました。
・生物種ごとの振分け表示。(生物種を入力すればリスト化できるが、存在する生物種を表示して欲しい)
・リスト化されたデータをソート(新しい・古い、名前、アクセス、更新頻度順など)。
・プロジェクト、組織ごとの分類表示。
・カテゴリを選択する度に一番上に戻らないようにして欲しい。
121019 integbioデータベースカタログ
・参考動画
生命科学系データベースカタログを使い倒す 2009
http://togotv.dbcls.jp/20090523.html#p01
WINGproを使ってバイオ分野の多様なデータベース
http://togotv.dbcls.jp/20080110.html#p01
創薬・疾患のためのデータベース横断検索サービスSagaceを使い倒す
http://togotv.dbcls.jp/20120809.html#p01
・参考データベース
Sagace
国内のデータベースを検索対象とした創薬・疾患研究のための生命科学分野のデータベース横断検索サービス
(調査)
・生物種ごとの振分けなし!
・()内の数字ははデータベースの数を表示
・見て呉れにサムネイル、公開中止情報あり
・ソート振分け機能なし
・データベースに関するユーザーのコメントなし
・リスト形式で、表示したいカラムを選択、ソートすることができない!
・一覧内の絞込み(対象、データの種類、稼働状況)
・見て呉れのデータベースの順番は何順か?
追加されたものは上にくる
(構成案)
・integbioデータベースカタログの説明
- 利用したいデータベースを様々な方法で検索・・
・()内の数字ははデータベースの数を表示
・見て呉れ(サムネイル、運用機関、データベースが扱う生物種、説明が表示)(公開休止、追加もサムネイルに表示されている)
*何順?
・データベースを利用するにはここをクリック→データベースのページに移動
・詳細へ→レコード詳細
・LSDBアーカイブ
・キーワードを記入し一覧内を検索できる
・カテゴリ一覧(対象、データの種類、稼働状況、その他の条件)
*データの種類クリック→()内の数が変化
*クリック→赤文字
- ex.データ種類(配列)+対象(ゲノム)+稼働状況(稼働中)+その他条件(LSDBアーカイブ修道)などの絞込みが可能
*全条件をリセット
どこに入れるか考慮中・・・
・メニューの説明(ホーム、更新履歴、ダウンロード、他のカタログ系サイト)+新着情報
の確認ができる
・生物種ごとの振分けなし。
・リスト形式で、表示したいカラムを選択、ソートすることができない。